いいえ、そんなことはないですよ。
ただ、「運用中のサイトを別テーマに変更して作り変える」ことにはさまざまなリスクを伴うので、おすすめはできません。
ともすれば、ウェブサイトが壊れて、大きな機会損失を生むことにもなりかねません。また、「データベース」という、テーマの設定などか書き込まれ保存されるところがあり、以前 適用していたテーマの設定などか そのデータベースにたくさん書き込まれたまま残る場合があります。
私はいつも、、更地 (別のドメインやサブドメイン) に新しいウェブサイトを作り、出来上がったら (アクセスの少ないタイミングを見計らって) 本番環境にまるっと上書きします。
(今回お立てになったトピックとは直接関係ない話題で恐縮です･･･)