どのような操作をされたことがきっかけでエラーが起きたのかを突き止める必要があるかと思いますが･･･
もしもまだ日が浅いようであれば、以下の方法 (ロリポップのサポートを頼る) が最も手っ取り早そうです。
≫ バックアップオプションを利用していませんが、復旧したいデータがあります – ヘルプセンター｜ロリポップ！レンタルサーバー
ただし、
サーバーの稼働状況にもよりますが、おおむね7日程度以前の状態まで保持されています。
とのことですので、もしもこちらの方法をお試しになるようでしたら、１日も早い対処を･･･