こんにちは。
サイトの該当箇所のソースコードを確認しました。
<div id="appeal" class="appeal adt-front-page-only">
<div id="appeal-in" class="appeal-in wrap">
<div class="appeal-content">
</div>
</div>
</div>これはファビコンスペースではなくて、Cocoonのテーマの機能にある「アピールエリア」のコードです。
管理画面の「Cocoon設定」 >「アピールエリア」のタブで「アピールエリアの表示」が「フロントページでのみ表示する」に設定されていると思います。
アピールエリアに表示するタイトルやテキストが設定されていないので、空のコンテンツ部分が白い四角で表示されています。
アピールエリアを使用するのであれば、タイトルやテキストを入力して「変更をまとめて保存」ボタンをクリックしてください。
アピールエリア自体が不要な場合は、「アピールエリアの表示」を「表示しない」に変更して、「変更をまとめて保存」ボタンをクリックしてください。
追加CSSのコードは、要らないと思うので削除しておいてください。